MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 120005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013446	AACC	2	8	11	18	50 %	0 %	0 %	50 %	264676137
2	NC_013446	ATG	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676137
3	NC_013446	CAGGC	2	10	26	35	20 %	0 %	40 %	40 %	264676137
4	NC_013446	AGC	2	6	80	85	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
5	NC_013446	AGA	2	6	126	131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
6	NC_013446	CTGGA	2	10	172	181	20 %	20 %	40 %	20 %	264676137
7	NC_013446	GTT	2	6	277	282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676137
8	NC_013446	CCT	2	6	298	303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676137
9	NC_013446	CAG	2	6	313	318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
10	NC_013446	GC	3	6	451	456	0 %	0 %	50 %	50 %	264676137
11	NC_013446	GCC	2	6	460	465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676137
12	NC_013446	GCT	2	6	567	572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676137
13	NC_013446	CGA	2	6	660	665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
14	NC_013446	CTCG	2	8	684	691	0 %	25 %	25 %	50 %	264676137
15	NC_013446	CTG	3	9	694	702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676137
16	NC_013446	CGA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
17	NC_013446	TTC	2	6	718	723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676137
18	NC_013446	CAA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676137
19	NC_013446	GAA	2	6	745	750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
20	NC_013446	TTC	2	6	751	756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676137
21	NC_013446	CTG	2	6	772	777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676137
22	NC_013446	AAG	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
23	NC_013446	TGA	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676137
24	NC_013446	GCC	2	6	888	893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676137
25	NC_013446	CAA	2	6	924	929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676137
26	NC_013446	CTT	2	6	969	974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676137
27	NC_013446	CGTG	2	8	999	1006	0 %	25 %	50 %	25 %	264676137
28	NC_013446	GC	3	6	1016	1021	0 %	0 %	50 %	50 %	264676137
29	NC_013446	GAAG	2	8	1056	1063	50 %	0 %	50 %	0 %	264676137
30	NC_013446	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
31	NC_013446	ACT	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676137
32	NC_013446	AAG	2	6	1192	1197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
33	NC_013446	A	6	6	1259	1264	100 %	0 %	0 %	0 %	264676137
34	NC_013446	CGG	2	6	1290	1295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676137
35	NC_013446	ACCAC	2	10	1301	1310	40 %	0 %	0 %	60 %	264676137
36	NC_013446	TGC	2	6	1313	1318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676137
37	NC_013446	CAG	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
38	NC_013446	AACA	2	8	1388	1395	75 %	0 %	0 %	25 %	264676137
39	NC_013446	TCAC	2	8	1479	1486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013446	GCCCT	2	10	1529	1538	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_013446	GCC	2	6	1545	1550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013446	CA	3	6	1607	1612	50 %	0 %	0 %	50 %	264676138
43	NC_013446	GCC	2	6	1660	1665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676138
44	NC_013446	AAG	2	6	1698	1703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676138
45	NC_013446	CAC	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676138
46	NC_013446	GCG	2	6	1771	1776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676138
47	NC_013446	CAC	3	9	1790	1798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676138
48	NC_013446	GCA	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676138
49	NC_013446	GAT	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676138
50	NC_013446	GGC	2	6	1893	1898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676138
51	NC_013446	CCG	2	6	1927	1932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676138
52	NC_013446	CTG	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
53	NC_013446	CTA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676138
54	NC_013446	TCG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
55	NC_013446	TGG	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676138
56	NC_013446	GCCTG	2	10	2122	2131	0 %	20 %	40 %	40 %	264676138
57	NC_013446	CTG	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
58	NC_013446	GCG	2	6	2230	2235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676138
59	NC_013446	CAA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676138
60	NC_013446	GGC	2	6	2292	2297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676138
61	NC_013446	GCT	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
62	NC_013446	CAT	2	6	2423	2428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676138
63	NC_013446	GTCG	2	8	2459	2466	0 %	25 %	50 %	25 %	264676138
64	NC_013446	CAA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676138
65	NC_013446	GATC	2	8	2621	2628	25 %	25 %	25 %	25 %	264676138
66	NC_013446	CGT	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
67	NC_013446	CAGC	2	8	2724	2731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013446	AGC	2	6	2756	2761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013446	AGC	2	6	2843	2848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013446	CCG	2	6	2891	2896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
71	NC_013446	GGC	2	6	2905	2910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
72	NC_013446	CAC	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
73	NC_013446	CGA	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
74	NC_013446	CGA	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
75	NC_013446	CCAT	2	8	3083	3090	25 %	25 %	0 %	50 %	264676139
76	NC_013446	GAC	2	6	3151	3156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
77	NC_013446	CGG	2	6	3210	3215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
78	NC_013446	GGC	2	6	3247	3252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
79	NC_013446	GGCGTG	2	12	3259	3270	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	264676139
80	NC_013446	CG	3	6	3347	3352	0 %	0 %	50 %	50 %	264676139
81	NC_013446	TCCT	2	8	3529	3536	0 %	50 %	0 %	50 %	264676139
82	NC_013446	AAC	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676139
83	NC_013446	GAC	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
84	NC_013446	CGG	2	6	3603	3608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
85	NC_013446	TCA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676139
86	NC_013446	AAG	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676139
87	NC_013446	CAC	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
88	NC_013446	GGC	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
89	NC_013446	GTGCT	2	10	3772	3781	0 %	40 %	40 %	20 %	264676139
90	NC_013446	CAA	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676139
91	NC_013446	CGG	2	6	3807	3812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
92	NC_013446	CACC	2	8	3813	3820	25 %	0 %	0 %	75 %	264676139
93	NC_013446	GC	3	6	3831	3836	0 %	0 %	50 %	50 %	264676139
94	NC_013446	AAG	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676139
95	NC_013446	CGA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
96	NC_013446	CCAG	2	8	3974	3981	25 %	0 %	25 %	50 %	264676139
97	NC_013446	CTGA	2	8	4045	4052	25 %	25 %	25 %	25 %	264676139
98	NC_013446	GAA	2	6	4060	4065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676139
99	NC_013446	ACG	2	6	4073	4078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
100	NC_013446	ATC	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676139
101	NC_013446	AGC	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
102	NC_013446	GC	3	6	4129	4134	0 %	0 %	50 %	50 %	264676139
103	NC_013446	CGC	2	6	4153	4158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
104	NC_013446	TCG	2	6	4241	4246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
105	NC_013446	CCG	2	6	4256	4261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
106	NC_013446	GCT	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
107	NC_013446	CCAG	2	8	4364	4371	25 %	0 %	25 %	50 %	264676139
108	NC_013446	ATC	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676139
109	NC_013446	AGC	3	9	4438	4446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
110	NC_013446	GAC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
111	NC_013446	ACC	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
112	NC_013446	CAT	4	12	4482	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676139
113	NC_013446	CTG	3	9	4531	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
114	NC_013446	CTT	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676139
115	NC_013446	GCC	2	6	4599	4604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
116	NC_013446	CGGCC	2	10	4650	4659	0 %	0 %	40 %	60 %	264676139
117	NC_013446	CAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676139
118	NC_013446	CGG	2	6	4710	4715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
119	NC_013446	GCC	2	6	4774	4779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
120	NC_013446	GC	3	6	4827	4832	0 %	0 %	50 %	50 %	264676139
121	NC_013446	ACC	3	9	4921	4929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
122	NC_013446	CCG	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
123	NC_013446	GCC	2	6	4994	4999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
124	NC_013446	CAC	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
125	NC_013446	CGC	2	6	5061	5066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
126	NC_013446	CGA	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
127	NC_013446	TCG	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
128	NC_013446	CTG	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
129	NC_013446	CG	3	6	5123	5128	0 %	0 %	50 %	50 %	264676139
130	NC_013446	CAC	2	6	5208	5213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
131	NC_013446	AGC	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
132	NC_013446	ACC	2	6	5269	5274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
133	NC_013446	CTG	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
134	NC_013446	CGA	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
135	NC_013446	CGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
136	NC_013446	GC	3	6	5403	5408	0 %	0 %	50 %	50 %	264676139
137	NC_013446	AGG	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676140
138	NC_013446	TTG	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676140
139	NC_013446	GCT	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676140
140	NC_013446	GCC	2	6	5647	5652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676140
141	NC_013446	AGCA	2	8	5670	5677	50 %	0 %	25 %	25 %	264676140
142	NC_013446	CTT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676140
143	NC_013446	ACCG	2	8	5745	5752	25 %	0 %	25 %	50 %	264676140
144	NC_013446	GCCG	2	8	5777	5784	0 %	0 %	50 %	50 %	264676140
145	NC_013446	TGC	2	6	5839	5844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676140
146	NC_013446	GC	3	6	5861	5866	0 %	0 %	50 %	50 %	264676140
147	NC_013446	CAT	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676140
148	NC_013446	CGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676141
149	NC_013446	TGA	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676141
150	NC_013446	GCT	2	6	6135	6140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676141
151	NC_013446	CCT	2	6	6190	6195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676141
152	NC_013446	GCA	2	6	6213	6218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676141
153	NC_013446	CAG	2	6	6248	6253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676141
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155	NC_013446	C	6	6	6349	6354	0 %	0 %	0 %	100 %	264676141
156	NC_013446	CGC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676141
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158	NC_013446	GCG	2	6	6415	6420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676141
159	NC_013446	GCCG	2	8	6431	6438	0 %	0 %	50 %	50 %	264676141
160	NC_013446	CCG	2	6	6499	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676141
161	NC_013446	AAC	2	6	6528	6533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676141
162	NC_013446	TGC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676141
163	NC_013446	GC	3	6	6665	6670	0 %	0 %	50 %	50 %	264676141
164	NC_013446	CAG	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676141
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166	NC_013446	GGA	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676141
167	NC_013446	CAA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676141
168	NC_013446	CAG	2	6	6887	6892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_013446	CGG	2	6	6897	6902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_013446	GCC	2	6	6978	6983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676142
171	NC_013446	GAA	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676142
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173	NC_013446	GGC	2	6	7092	7097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676142
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186	NC_013446	TGG	2	6	7457	7462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676142
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188	NC_013446	CG	3	6	7573	7578	0 %	0 %	50 %	50 %	264676142
189	NC_013446	GAC	2	6	7584	7589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676142
190	NC_013446	CAG	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676142
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193	NC_013446	TTG	2	6	7666	7671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676142
194	NC_013446	CGG	2	6	7769	7774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_013446	CCA	2	6	7804	7809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676143
196	NC_013446	GCTGCC	2	12	7829	7840	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	264676143
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199	NC_013446	GC	3	6	7873	7878	0 %	0 %	50 %	50 %	264676143
200	NC_013446	GGC	2	6	7884	7889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676143
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220	NC_013446	TCG	3	9	8779	8787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676144
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223	NC_013446	GCG	2	6	8897	8902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676144
224	NC_013446	CAG	2	6	8928	8933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676144
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230	NC_013446	TCG	2	6	9163	9168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676144
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233	NC_013446	CCCA	2	8	9253	9260	25 %	0 %	0 %	75 %	264676144
234	NC_013446	CCGT	2	8	9322	9329	0 %	25 %	25 %	50 %	264676144
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241	NC_013446	GCG	2	6	9742	9747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676144
242	NC_013446	CG	4	8	9770	9777	0 %	0 %	50 %	50 %	264676144
243	NC_013446	GGC	2	6	9781	9786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676144
244	NC_013446	GCA	2	6	9806	9811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676144
245	NC_013446	TGA	2	6	9833	9838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676144
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247	NC_013446	GCC	2	6	9866	9871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
248	NC_013446	G	6	6	9896	9901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
249	NC_013446	CCA	2	6	10008	10013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676145
250	NC_013446	GC	4	8	10021	10028	0 %	0 %	50 %	50 %	264676145
251	NC_013446	CGC	2	6	10035	10040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676145
252	NC_013446	GCC	2	6	10093	10098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676145
253	NC_013446	CGCC	2	8	10104	10111	0 %	0 %	25 %	75 %	264676145
254	NC_013446	GCC	2	6	10129	10134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676145
255	NC_013446	CAT	2	6	10234	10239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676145
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257	NC_013446	GCA	2	6	10269	10274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676145
258	NC_013446	GCG	2	6	10287	10292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676145
259	NC_013446	GCC	2	6	10336	10341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676145
260	NC_013446	GCA	2	6	10344	10349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676145
261	NC_013446	GTC	2	6	10357	10362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676145
262	NC_013446	CGCGC	2	10	10387	10396	0 %	0 %	40 %	60 %	264676145
263	NC_013446	AGC	2	6	10397	10402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676145
264	NC_013446	CG	3	6	10422	10427	0 %	0 %	50 %	50 %	264676145
265	NC_013446	CTCG	2	8	10428	10435	0 %	25 %	25 %	50 %	264676145
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394	NC_013446	CGC	2	6	14953	14958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676149
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402	NC_013446	TGC	2	6	15238	15243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676149
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453	NC_013446	GCGCC	2	10	17005	17014	0 %	0 %	40 %	60 %	264676151
454	NC_013446	CGG	2	6	17128	17133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676151
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500	NC_013446	TCT	2	6	18706	18711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676152

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